Les matériaux des boîtes de Pétri sont essentiellement divisés en deux catégories, principalement le plastique et le verre. Le verre peut être utilisé pour les matières végétales, la culture microbienne et la culture adhérente de cellules animales. Le plastique peut être en polyéthylène, jetable et multi-usage. Il convient à l'inoculation en laboratoire, au traçage et à la séparation des bactéries. Il peut être utilisé pour la culture de matières végétales.
